Molecules-Extension für MediaWiki

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Molecules-Extension für MediaWiki

Die MediaWiki-Erweiterung Molecules-Extension für MediaWiki erlaubt das Management chemischer Moleküle und Reaktionen.

Was kann die Extension?

Mit der Molecules-Extension können Sie Ihre MediaWiki-Installation um die Möglichkeit erweitern, chemische Moleküle und Reaktionen innerhalb per Point-und-Click Interface einzugeben und sie in beliebigen Wikiseiten anzuzeigen.

Die Erweiterung benutzt den weitverbreiteten Molekül-Editor Ketcher 2.0 und bietet eine Reihe von Funktionen:

  • Editieren von Molekülen und Reaktionen integriert in den VisualEditor vom MediaWiki
  • Unterstützung verschiedener Formate, z.B. Molfile/Rxnfile und SMILES
  • Auto-Layout und manuelles Layout wird unterstützt
  • Unterstützung verschiedener Bindungstypen
  • automatische Berechnung von Metadaten, z.B. International Chemical Identifier (InChI und InchiKey)
  • Darstellung von Molekülen und Reaktionen eingebettet in Wiki-Seiten
  • automatische Erzeugung von eigenständigen Wiki-Seiten für jedes Molekül

Download

Aktuell können Sie die Extensin nur von DIQA beziehen. Bitte kontaktieren Sie uns via Kontaktformular am Ende dieser Seite.

Installation

  • Legen Sie im Extension-Verzeichnis ein Unterverzeichnis "Molecules" an und kopieren Sie den Code hinein.
  • Fügen Sie die folgenden Zeilen in LocalSettings.php ein.
define('NS_MOLECULE', 3300);
define('NS_MOLECULE_TALK', 3301);
$wgExtraNamespaces[NS_MOLECULE] = 'Molecule';
$wgExtraNamespaces[NS_MOLECULE_TALK] = 'Molecule_talk';
define('NS_REACTION', 3302);
define('NS_REACTION_TALK', 3303);
$wgExtraNamespaces[NS_REACTION] = 'Reaction';
$wgExtraNamespaces[NS_REACTION_TALK] = 'Reaction_talk';
wfLoadExtension('ChemExtension');
  • Falls Sie Semantic MediaWiki installiert haben und nutzen wollen, fügen Sie auch noch die folgenden Zeilen ein:
$smwgNamespacesWithSemanticLinks[NS_MOLECULE] = true;
$smwgNamespacesWithSemanticLinks[NS_REACTION] = true;
$smwgNamespacesWithSemanticLinks[NS_TEMPLATE] = true;

Überprüfen der erfolgreichen Installation

Besuchen sie die Spezial:Version oder Special:Version Ihres Wikis und finden Sie die Molecules-Extension in der Liste "weiteren Extensions" mit entsprechender Versionsnummer.

Screenshots

Editor-Ansicht

Molecules-form3.png Molecules-editor3.png

Ansicht des gerenderten Moleküls auf einer Wikiseite

Molecules-rendered.png

Kompatibilität

  • MediaWiki: mind. Version 1.35.x
  • PHP: mind. v7.4.x
  • VisualEditor: mind. v0.1.2
  • Semantic MediaWiki: mind. v3.2.x
  • Molfile v2000 und v3000

Weitere Links

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Dr Michael Erdmann
Dr Michael Erdmann
Semantic Web Consultant, Projektmanager
Tel.: +49-176 64078339
[email protected]