Molecules: Unterschied zwischen den Versionen

Aus DIQA-Homepage
Wechseln zu:Navigation, Suche
Zeile 28: Zeile 28:
 
* Darstellung von Molekülen und Reaktionen eingebettet in Wiki-Seiten
 
* Darstellung von Molekülen und Reaktionen eingebettet in Wiki-Seiten
 
* automatische Erzeugung von eigenständigen Wiki-Seiten für jedes Molekül
 
* automatische Erzeugung von eigenständigen Wiki-Seiten für jedes Molekül
 +
 +
== Download ==
 +
Aktuell können Sie die Extensin nur von DIQA beziehen. Bitte kontaktieren Sie uns via Kontaktformular am Ende dieser Seite.
 +
 +
=== Installation ===
 +
* Legen Sie im Extension-Verzeichnis ein Unterverzeichnis "Molecules" an und kopieren Sie den Code hinein.
 +
* Fügen Sie die folgenden Zeilen in <code>LocalSettings.php</code> ein.
 +
define('NS_MOLECULE', 3300);
 +
define('NS_MOLECULE_TALK', 3301);
 +
$wgExtraNamespaces[NS_MOLECULE] = 'Molecule';
 +
$wgExtraNamespaces[NS_MOLECULE_TALK] = 'Molecule_talk';
 +
define('NS_REACTION', 3302);
 +
define('NS_REACTION_TALK', 3303);
 +
$wgExtraNamespaces[NS_REACTION] = 'Reaction';
 +
$wgExtraNamespaces[NS_REACTION_TALK] = 'Reaction_talk';
 +
wfLoadExtension('ChemExtension');
 +
* Falls Sie SemanticMediaWiki installiert haben und nutzen wollen, fügen Sie auch noch die folgenden Zeilen ein:
 +
$smwgNamespacesWithSemanticLinks[NS_MOLECULE] = true;
 +
$smwgNamespacesWithSemanticLinks[NS_REACTION] = true;
 +
$smwgNamespacesWithSemanticLinks[NS_TEMPLATE] = true;
 +
 +
=== Überprüfen der erfolgreichen Installation ===
 +
Besuchen sie die <code>Spezial:Version</code> oder <code>Special:Version</code> Ihres Wikis und finden Sie die
 +
Molecules-Extension in der Liste "weiteren Extensions" mit entsprechender Versionsnummer.
  
 
== Screenshots ==
 
== Screenshots ==
Zeile 36: Zeile 60:
  
 
=== Ansicht des gerenderten Moleküls auf einer Wikiseite ===
 
=== Ansicht des gerenderten Moleküls auf einer Wikiseite ===
{|style="border-style: solid; border-width: 1px;;
+
{|style="border-style: solid; border-width: 1px;"
 
| [[Datei:Molecules-rendered.png]]
 
| [[Datei:Molecules-rendered.png]]
 
|}
 
|}
Zeile 43: Zeile 67:
 
* KETCHER2:  https://lifescience.opensource.epam.com/ketcher/#ketcher-2-0
 
* KETCHER2:  https://lifescience.opensource.epam.com/ketcher/#ketcher-2-0
 
* SMILES: https://daylight.com/smiles/
 
* SMILES: https://daylight.com/smiles/
 +
* VisualEditor: https://www.mediawiki.org/wiki/Extension:VisualEditor
 +
* SemanticMediaWiki: https://www.semantic-mediawiki.org/
  
 
== Bitte um Rückruf ==
 
== Bitte um Rückruf ==

Version vom 2. September 2022, 09:11 Uhr

Hauptseite > Lösungen > Molecules-Extension für MediaWiki

Molecules-Extension für MediaWiki

Die MediaWiki-Erweiterung Molecules-Extension für MediaWiki erlaubt das Management chemischer Moleküle und Reaktionen.

Was kann die Extension?

Mit der Molecules-Extension können Sie Ihre MediaWiki-Installation um die Möglichkeit erweitern, chemische Moleküle und Reaktionen innerhalb per Point-und-Click Interface einzugeben und sie in beliebigen Wikiseiten anzuzeigen.

Die Erweiterung benutzt den weitverbreiteten Molekül-Editor Ketcher 2.0 und bietet eine Reihe von Funktionen:

  • Editieren von Molekülen und Reaktionen integriert in den VisualEditor vom MediaWiki
  • Unterstützung verschiedener Formate, z.B. Molfile/Rxnfile und SMILES
  • Auto-Layout und manuelles Layout wird unterstützt
  • Unterstützung verschiedener Bindungstypen
  • automatische Berechnung von Metadaten, z.B. International Chemical Identifier (InChI und InchiKey)
  • Darstellung von Molekülen und Reaktionen eingebettet in Wiki-Seiten
  • automatische Erzeugung von eigenständigen Wiki-Seiten für jedes Molekül

Download

Aktuell können Sie die Extensin nur von DIQA beziehen. Bitte kontaktieren Sie uns via Kontaktformular am Ende dieser Seite.

Installation

  • Legen Sie im Extension-Verzeichnis ein Unterverzeichnis "Molecules" an und kopieren Sie den Code hinein.
  • Fügen Sie die folgenden Zeilen in LocalSettings.php ein.
define('NS_MOLECULE', 3300);
define('NS_MOLECULE_TALK', 3301);
$wgExtraNamespaces[NS_MOLECULE] = 'Molecule';
$wgExtraNamespaces[NS_MOLECULE_TALK] = 'Molecule_talk';
define('NS_REACTION', 3302);
define('NS_REACTION_TALK', 3303);
$wgExtraNamespaces[NS_REACTION] = 'Reaction';
$wgExtraNamespaces[NS_REACTION_TALK] = 'Reaction_talk';
wfLoadExtension('ChemExtension');
  • Falls Sie SemanticMediaWiki installiert haben und nutzen wollen, fügen Sie auch noch die folgenden Zeilen ein:
$smwgNamespacesWithSemanticLinks[NS_MOLECULE] = true;
$smwgNamespacesWithSemanticLinks[NS_REACTION] = true;
$smwgNamespacesWithSemanticLinks[NS_TEMPLATE] = true;

Überprüfen der erfolgreichen Installation

Besuchen sie die Spezial:Version oder Special:Version Ihres Wikis und finden Sie die Molecules-Extension in der Liste "weiteren Extensions" mit entsprechender Versionsnummer.

Screenshots

Editor-Ansicht

Molecules-form3.png Molecules-editor3.png

Ansicht des gerenderten Moleküls auf einer Wikiseite

Molecules-rendered.png

Weitere Links

Bitte um Rückruf

Datenschutzrichtlinie

* Diese Felder sind notwendig.

ihr ansprechpartner
Dr Michael Erdmann
Dr Michael Erdmann
Semantic Web Consultant, Projektmanager
Tel.: +49-176 64078339
[email protected]